战国时代
日本战国时代，皇权没落，武士阶级治世，阴阳师逐渐从历史舞台消失。不过，各地大名身边军师的前身大部分仍是阴阳师。
战国大名们都很在意占卦，武将手中的军扇，就是咒术的一种。军扇两面各画有日、月，万一碰到不得不出战的凶日，便在白天把军扇的月亮面显现在表面，让日夜颠倒，以便将凶日化为吉日。
阴阳师们虽然官阶并不高，但却多受权臣贵族的仰仗，其地位远远凌驾于一般官员和武士之。
江户时代
德川家康开设江户幕府的时候，五行兴替的思想再次被般出来。阴阳道才再次走近政治的中心。
安倍家直系后裔土御门家再次兴旺，嗣子断绝的贺茂家也凭借的支流幸德井家再兴。
但是两家竞争日益白热化，到了江户时代中期，土御门神道终于彻底击败了幸德井家取得了全日本阴阳师的支配权。
阴阳师[奉行阴阳道的术师]
明治时代
明治维新后，出于政治的需要，阴阳道被冠以“淫祠邪教”被明治政府废止，部分内容被以民间信仰的名义残存下来，神道教正式与阴阳道决裂。
阴阳寮
阴阳寮构成：寮头一人、寮助一人、允官一人、大属职一人、小属职一人、阴阳师六人、阴阳博士二人、阴阳生十人、阴阳士一人、皇历博士一人、皇历生十人、天文博士一人、天文生十人、漏刻博士二人、守辰丁二十人、使部二十人、值丁二人。
工作内容主要包括：
1。阴阳道：判断土地凶吉的相地堪舆与占筮。
2。历道：制定日历，决定日子凶吉。
3。天文道：观测天体，卜筮，思考慧星侧隐。
4。漏刻：掌管控制时间。
操纵式神
式神者，式也。
星占里的三式，即式占。
最早的原义是栻盤。一种用来模拟天地运行的木盤。引申出式的概念
阴阳师操控式神是阴阳术师的主要法力技能。
有通过封印函定下契约书的，有通过结印方法降服的，有以朋友关系自愿递交，可以剪纸而成形，只要念出约定的咒语，随时控制召唤出来，连人的魂魄都可以使用，也有以活的生物为凭借做为式神。
《大镜》中记载，晴明将式神当作仆人一样使用，经常吩咐式神倒茶开门。
《宇治拾遗物语》中记载，有一次，晴明因事前往宫中参谒天皇，碰到了藏人少将。这时，一只鸟飞过少将头顶，遗下一滩鸟粪。
见此情形，晴明立刻意识到那只鸟是式神，少将被人施了杀死咒。于是立刻将少将带回自己家中，一整晚都为少将做护身之法。
到了黎明时分，有一人来向晴明坦白，说他找了其他阴阳师，企图咒杀少将，而那位阴阳师施法的式神由于晴明的护身法而不能将少将杀死，反而将自己的主人杀死。